解题思路：A、根据质子和电子都带电考虑；B、根据原子的构成考虑；C、根据分子的特点考虑；D、根据化合物定义考虑．
A、一个质子带一个单位正电荷，一个电子带1个单位负电荷，所以带电的粒子不一定是离子，故A错；
B、原子分为原子核和核外电子，故B错；
C、分子是保持物质化学性质的最小粒子，故C错；
D、化合物是由不同元素组成的纯净物，所以化合物最少有两种元素，故D正确．
故选D．
点评：
本题考点： 原子的定义与构成；单质和化合物的概念；分子的定义与分子的特性．
考点点评： 解答本题关键是要知道带电荷的原子或原子团属于离子，原子可以再分，化合物最少有两种元素．