解题思路：根据金属和大多数固态非金属单质等由原子构成，有些物质是由分子构成的，如水、气态非金属单质等，有些物质是由离子构成的，如氯化钠，进行分析判断即可．
A、氢氧化钠是由钠离子和氢氧根离子构成的，故选项错误．
B、氯化钙是由钙离子和氯离子构成的，故选项错误．
C、铝属于金属单质，是由铝原子直接构成的，故选项错误．
D、水是由水分子构成的，故选项正确．
故选D．
点评：
本题考点： 物质的构成和含量分析．
考点点评： 本题难度不大，主要考查了构成物质的微观粒子方面的知识，掌握常见物质的粒子构成是正确解答本题的关键．