解题思路：A、分子原子离子都可构成物质．
B、原子是化学变化中最小的粒子．
C、不同的原子质子数一定不同．
D、质子数与核内中子数没有必然的联系．
A、分子原子离子都可构成物质，故此选项错误．
B、原子是化学变化中最小的粒子，也就是不可再分，故此选项正确
C、不同的原子质子数一定不同，同类原子质子数一定相同，故此选项错误．
D、质子数与核内中子数没有必然的联系，所以质子数与中子数不一定相等，故此选项错误．
故选B
点评：
本题考点： 原子的定义与构成．
考点点评： 此题是对原子知识的考查，解题的关键是对原子的特点及不同原子的区别有较清晰的认识．