解题思路：（1）根据我们对于微观世界中分子和原子核式结构模型得出结论；
（2）根据我们对于原子核式结构的认识得出正确的结论．
（1）分子是保持物质化学性质的最小微粒，卢瑟福进行了α粒子散射实验后，提出了原子核式结构模型．
（2）原子是由处于核心的原子核和核外电子构成的．
（3）对物质结构的研究成果也正是许多哲学家朴素唯物主义思想的渊源．
故答案为：分子；卢瑟福；C．
点评：
本题考点： 分子和原子组成物质；原子的核式模型．
考点点评： 此题考查的是我们对于微观世界的了解，是一道基础题．
（2009•芜湖）物理学中一个基本的观念是“世界是由物质组成的”．