解题思路：此题涉及了遗传物质、植物的特点、真菌的特点等内容，逐一分析解答．
（1）DNA是遗传物质，但并不是所有生物的遗传物质都是DNA，如大部分病毒的遗传物质是DNA，少数病毒的遗传物质是RNA 病毒分为有DNA病毒，RNA病毒，阮病毒．故错误．
（2）在自然界中以二氧化碳为主要碳源进行生长的生物叫自养生物，主要包括植物和部分微生物，并不只是植物，自养性微生物其具有代表性的例子是红色无硫细菌、红色硫细菌、绿色硫细菌、硝化细菌、硫细菌、氢细菌、铁细菌、一氧化碳细菌等．故错误．
（3）酵母菌属于真菌，兼气厌氧型，其实质并非厌氧，它也可在氧气中有氧呼吸．故错误．
故答案为：（1）×（2）×（3）×
点评：
本题考点： 生物的分类及分类单位．
考点点评： 此题有一定的难度，可借助于查阅相关的资料，仔细分析．