解题思路：1、植物组织培养过程是：离体的植物器官、组织或细胞脱分化形成愈伤组织，然后再分化生成根、芽，最终形成植物体．植物组织培养依据的原理是植物细胞的全能性．
2、基因突变的特征有：普遍性、随机性、低频性、不定向性、多害少利性．
3、单倍体育种是植物育种手段之一．即利用植物组织培养技术（如花药离体培养等）诱导产生单倍体植株，再通过某种手段使染色体组加倍（如用秋水仙素处理），从而使植物恢复正常染色体数．
A、培育转基因的外植体得到的新个体属于基因重组个体，A错误；
B、理化因素可诱导产生基因突变，基因突变具有不定向性及多害少利性，B错误；
C、单倍体育种包括花药离体培养和秋水仙素处理两个过程，C错误；
D、植物组织培养技术的理论基础是细胞的全能性，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 植物培养的条件及过程
考点点评： 本题综合考查了植物组织培养、基因突变、单倍体育种等相关知识，意在考查学生的分析和理解能力．植物组织培养技术已经得到广泛应用，包括：植物繁殖的新途径（如微型繁殖、作物脱毒、人工种子）、作物新品种的培育（如单倍体育种、突变体的应用）、细胞产物的工厂化生产（如从培养的红豆杉细胞中提取抗肿瘤药物紫杉醇）．