解题思路：1、基因自由组合定律的实质是：位于非同源染色体上的非等位基因的分离或自由组合是互不干扰的；在减数分裂过程中，同源染色体上的等位基因彼此分离的同时，非同源染色体上的非等位基因自由组合．
2、逐对分析法：首先将自由组合定律问题转化为若干个分离定律问题；其次根据基因的分离定律计算出每一对相对性状所求的比例，最后再相乘．
黄色皱粒（Yyrr）豌豆能产生Yr和yr两种配子，比例为1：1；绿色圆粒（yyRr）豌豆能产生yR和yr两种配子，比例为1：1；因此，它们杂交后代有YyRr、Yyrr、yyRr、yyrr，比例为1：1：1：1．
故选：A．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因分离定律的实质及应用、基因自由组合定律的实质及应用，要求考生掌握基因分离定律的实质，能准确判断两对相对性状的显隐性；掌握基因自由组合定律的实质，能采用逐对分析法进行简单的概率计算．