解题思路：生态系统的营养结构是指食物链和食物网．食物链的起点是生产者，终点是最高营养级的消费者，生产者是第一营养级，植食性动物是初级消费者，第二营养级，以植食性动物为食的动物是次级消费者，第三营养级，以此类推．
A、以植食性动物为食的动物称为次级消费者，A错误；
B、以植食性动物为食的动物属于第三营养级，B错误；
C、以植食性动物为食的动物只能获得植食性动物同化的少部分能量，C正确；
D、一般采用标志重捕法调查其种群密度，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： A:生态系统的结构 B:估算种群密度的方法
考点点评： 本题主要考查生态系统的营养结构，意在强化学生对相关知识的识记、理解与运用．