解题思路：判断一个变化是物理变化还是化学变化，要依据在变化过程中有没有生成其他物质，生成其他物质的是化学变化，没有生成其他物质的是物理变化．
A、石墨是最软的矿物之一，金刚石是自然界中存在的最硬的物质之一，所以二者不属于相同物质，由一种物质变为另一种物质属于化学变化，故错误．
B、石墨是最软的矿物之一，金刚石是自然界中存在的最硬的物质之一，所以二者不属于相同物质，由一种物质变为另一种物质属于化学变化，故正确．
C、由质量守恒定律可知，变化中元素的种类不变化，故错误．
D、金刚石和石墨都是碳元素组成的单质，由原子直接构成，故错误．
故选：B
点评：
本题考点： 碳元素组成的单质；化学变化和物理变化的判别；质量守恒定律及其应用．
考点点评： 搞清楚物理变化和化学变化的本质区别是解答本类习题的关键．判断的标准是看在变化中有没有生成其他物质．一般地，物理变化有物质的固、液、气三态变化和物质形状的变化．