解题思路：生物多样性的内容包括：生物种类的多样性、遗传的多样性、生态系统的多样性．杂交水稻是杂交育种，属于遗传学的范畴．
A、生态系统的多样性指的是各种各样的生物和其生活环境．A错误；
B、生物种类的多样性是指一定区域内物种的丰富程度．即物种的多样性．B错误；
C、生活环境的是指生物赖以生存的各种各样的环境．C错误；
D、基因的多样性也是指遗传的多样性，是指各种生物体内各种各样的基因．D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 生物的多样性的内涵．
考点点评： 回答此题的关键是要明确杂交水稻所属的范畴．