解题思路：高等植物叶绿体具有双层膜、少量DNA，光合色素等，是植物进行光合作用的场所．
A、高等植物细胞内具有双层膜的结构有叶绿体、线粒体、细胞膜，A正确；
B、在叶绿体的类囊体薄膜上含有光合色素，可以吸收、传递、转化光能，其中只有少数叶绿素a具有转化光能的作用，B正确；
C、在叶绿体中，光合色素仅分布在类囊体薄膜上，基质中没有，C错误；
D、叶绿体基质中含有与光合作用暗反应有关的酶，D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 叶绿体结构及色素的分布和作用．
考点点评： 本题考查叶绿体结构及色素的分布和作用的相关知识，意在考查考生理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系、分析题意以及解决问题的能力．