解题思路：根据物理学史和常识解答，记住著名物理学家的主要贡献即可．
A、卢瑟福在用a粒子轰击金箔的实验中发现了质子，提出原子核式结构学说，通过实验可以估算原子核的半径，而不是核外电子的运动半径，故A正确，B错误
C、处于激发态的氢原子放出光子后，将低能级跃迁，运动半径减小，其动能增大，电势能减小，总能量也减小，故C错误，D正确；
故选：AD．
点评：
本题考点： 粒子散射实验；原子的核式结构；氢原子的能级公式和跃迁．
考点点评： 本题考查物理学史，是常识性问题，对于物理学上重大发现、发明、著名理论要加强记忆，这也是考试内容之一．