解题思路：根据原子是由原子核和核外电子组成，原子核由质子和中子组成（质子带正电，中子不带电），相对原子质量=质子数+中子数；在原子中，质子数=核电荷数；进行分析解答本题．
A、在原子中，质子数=核电荷数，故正确；
B、在原子中，相对原子质量=质子数+中子数，故正确；
C、在原子中质子数与中子数不一定相等但也不一定不等，如氧原子核内质子数与中子数就都是8，故错误；
D、原子是由质子、中子、电子三种微粒构成，氢原子（只有质子而没有中子）除外，故正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 原子的定义与构成．
考点点评： 本题主要考查原子的构成，相对原子质量，及质子数与核电荷数的关系．