解题思路：白化病患者属于常染色体隐性遗传病，所以正常情况下，双亲都是白化病患者，后代肯定患病；等位基因在减数分裂过程中分离，后代组合后会出现性状分离；基因是双链DNA分子的片段，其以一条链为模板，转录形成RNA，再经翻译形成多肽；由于后代果蝇中灰身长翅和黑身残翅多，灰身残翅与黑身长翅少，则说明在减数分裂过程中，控制生物性状的两对基因发生了交叉互换．
①双亲都是白化病患者，其基因型都是aa，婚配产生的后代也都是aa，所以一般不会生出正常孩子，正确；
②若两只杂合豚鼠交配，后代出现白豚鼠，原因是减数分裂时等位基因分离，产生后代量出现了性状分离，错误；
③某基因中含1200个碱基，则mRNA中含600个碱基，而在mRNA中，每相邻的3个碱基决定1个氨基酸，所以氨基酸最多为200个，又由于mRNA中含有的终止密码不决定氨基酸，因此该基因控制合成的多肽中氨基酸的个数肯定不是200个，要少于200个，正确；
④灰身长翅果蝇与黑身残翅果蝇杂交，如果非等位基因在减数第一次分裂中发生了自由组合，则后代果蝇中灰身长翅、黑身残翅、灰身残翅、黑身长翅各占25%，错误．
故选C．
点评：
本题考点： 基因的分离规律的实质及应用；基因、蛋白质与性状的关系；基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查遗传定律、基因控制蛋白质合成的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．