解题思路：1、生态系统的组分越多和食物网越复杂，自我调节能力就越强，则抵抗力稳定性越强，恢复力稳定性越弱．
2、生态系统能量流动的特点是单向流动，逐级递减．
3、脱水的个数=肽键个数=氨基酸个数n-链数m．
A、a、b、c、d表示四个同类型的生态系统，d的遗传多样性最高，最能适应剧烈变化的环境，A错误；
B、a、b、c、d表示四个同类型的生态系统，a营养结构越简单，恢复力稳定性最强，B错误；
C、若Y表示种群的能量值，由于能量流动的特点是单向流动，逐级递减，a能量最少，a可能位于最高营养级，bc的能量基本相等，处于同一营养级，则可能有食物链b→c（d）→a，C错误；
D、a、b、c、d表示构成某蛋白质的四条肽链，其中a含有2个氨基酸，b含有4个氨基酸，c含有6个氨基酸，d含有52个氨基酸，则脱水分子数=（2+4+6+52）-4=60个，则该蛋白质彻底水解需要的H2O分子数至少为60个，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 生态系统的稳定性；蛋白质的合成——氨基酸脱水缩合；生态系统的结构．
考点点评： 本题比较复杂，涉及知识点多，包括种群、生态系统、食物链和生物多样性、氨基酸的脱水缩合等，要求学生不仅熟练掌握基础知识，而且能灵活的将知识进行知识整合和分析．