解题思路：氨基酸是组成蛋白质的基本单位，其结构通式为
，可见其结构特点是：每种氨基酸都至少含有一个氨基和一个羧基，并且他们都连结在同一个碳原子上．据此答题．
根据氨基酸的结构通式可以判断出图中①、③、④和⑥都属于组成蛋白质的氨基酸，而②和⑤不属于组成蛋白质的氨基酸．因此由①、③、④和⑥这四个氨基酸组成的一条肽链，含有3个肽键．
故选：C．
点评：
本题考点： 氨基酸的分子结构特点和通式；蛋白质的合成——氨基酸脱水缩合．
考点点评： 本题考查氨基酸的结构特点、蛋白质合成--氨基酸脱水缩合，要求考生识记氨基酸的结构通式，掌握氨基酸的结构特点，能准确判断图中各分子是否属于氨基酸；掌握氨基酸脱水缩合过程的中的相关计算．