解题思路：根据对顶角的定义及性质判断①；
根据垂线的性质判断②；
根据同位角的定义判断③；
根据中点的定义判断④；
根据两点间的距离判断⑤．
①相等的角不一定是对顶角，可以是矩形的两个内角，故说法错误；
②根据垂线的唯一性可知，过一点有且只有一条直线与已知直线垂直，故说法正确；
③根据同位角的定义：两条直线被第三条直线所截形成的角中，若两个角都在被截两直线的同侧，并且在第三条直线（截线）的同旁，则这样一对角叫做同位角，故说法错误；
④若点P不在线段AB上，即使线段AP=BP，那么P也不是AB中点，故说法错误；
⑤A与B两点间的距离是指连接A、B两点间的线段的长度，故说法错误．
故选D．
点评：
本题考点： 对顶角、邻补角；两点间的距离；垂线；同位角、内错角、同旁内角．
考点点评： 本题考查了对顶角的定义及性质，垂线的性质，同位角的定义，线段中点的定义，两点间的距离的定义，属于基础知识，比较简单．