解题思路：线粒体是有氧呼吸的主要场所，细胞需要的能量有90%以上来自线粒体，线粒体中含有少量的DNA和RNA，因此是能自主复制的细胞器．
A、线粒体中进行有氧呼吸的第二、三阶段，把储存在有机物中的化学能转变成热能和储存在ATP中的化学能，因此与能量的转换有关，A正确；
B、线粒体有氧呼吸的主要场所，细胞需要的能量有90%以上来自线粒体，B正确；
C、线粒体中含有少量DNA和RNA，C正确；
D、线粒体是有氧呼吸的主要场所，能把有机物转变成无机物，D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 线粒体、叶绿体的结构和功能．
考点点评： 本题的知识点是线粒体的结构、功能，对于线粒体结构、功能的理解是解题的关键．