如果仅仅说疏水的侧链的话,一般是指R基.也并非所有氨基酸R基都疏水,看一下统计：
甘氨酸 亲水性
丙氨酸 疏水性
缬氨酸 疏水性
亮氨酸 疏水性
异亮氨酸 疏水性
苯丙氨酸 疏水性
色氨酸 疏水性
酪氨酸 疏水性
天冬氨酸 酸性
天冬酰胺 亲水性
谷氨酸 酸性
赖氨酸 碱性
谷氨酰胺 亲水性
甲硫氨酸 疏水性
丝氨酸 亲水性
苏氨酸 亲水性
半胱氨酸 亲水性
脯氨酸 疏水性
组氨酸 碱性
精氨酸 碱性
可以看到,一般疏水的R基是长的烃连或者含有苯环的.
疏水的氨基酸残基一般都被包埋在了蛋白的内部,很多都是活性中心呢：）