蛋白质凝胶电泳后或者质谱后怎么鉴定?

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看你的目的.如果你只是检测目标蛋白大小的话,加上蛋白质marker,考染观察条带大小即可.你要是想知道蛋白质的氨基酸序列的话就去打质谱.
话说蛋白质的质谱就是序列分析.