解题思路：阅读题干可知，本题涉及的知识有线粒体、叶绿体、溶酶体等细胞器结构和功能以及病毒、原核细胞的结构，明确知识点，梳理相关的基础知识，结合问题的具体提示综合作答．
A、进行有氧呼吸的原核生物如醋酸菌没有线粒体，需氧生物的细胞质基质中也能够为生命活动提供能量，A错误；
B、溶酶体中的水解酶不是自身合成的，而是来自核糖体合成、高尔基体加工，B错误；
C、叶绿体和线粒体都是双层膜，两者都含有磷脂、DNA和多种酶，叶绿体中还含有色素，是光合作用的场所，C正确；
D、噬菌体属于DNA病毒，并无细胞的结构，所以没有核糖体这种细胞器，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 线粒体、叶绿体的结构和功能；原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同；细胞器中其他器官的主要功能．
考点点评： 本题考查细胞结构和功能的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力．