解题思路：（1）叶绿体的色素提取的方法是纸层析法；
（2）影响实验结构的因素有：未加碳酸钙导致色素被破坏；未加石英砂导致研磨不充分，色素含量少；使用不新鲜的绿叶；滤液线溶于层析液中等因素；
（3）色素主要吸收蓝紫光和红橙光，绿光几乎不不吸收，所以看到的绿光；反射光下呈现红色的原因是：由于溶液中的色素吸收了蓝紫光后不能用于光合作用（没有了相应的酶系统），形成荧光重新辐射出来，因为能量在吸收--辐射过程中有一部分转化成热能损失了，所以荧光是比蓝紫光能量少的红光，看到的就是红光了．
（1）教材中叶绿体中色素提取与分离的实验所采用的方法是通过层析液在滤纸上扩散而对色素进行层析分离，所以叫纸层析法．
（2）使用同一滤液其他同学实验成功，而某同学滤纸条上无色素分带现象，可见该同学失败的原因不在层析液，其主要原因是层析时滤纸条上滤液细线浸入到层析液，而使大量的色素溶于层析液中．
（3）同是叶绿体中的色素液，在不同光下所能观察到颜色是不同的，透射光下看到是绿色，反射光下看到的是红色．
故答案为：
（1）纸层析法
（2）滤液细线浸入层析液中
（3）透射 反射
点评：
本题考点： 叶绿体色素的提取和分离实验．
考点点评： 本题考查叶绿体的色素的提取和分离实验，对应此类试题，需要考生注意的细节较多，如实验的原理、实验材料的选取是否合理、实验采用的试剂及试剂的作用、实验现象的分析等，要求考生在平时的学习过程中注意积累．